滴虫能够吞噬精子，且患滴虫性阴道炎时，阴道内脓性分泌物大量增多，分泌物中含有大量的白细胞，这些都会妨碍精子的成活，使精子数量减少。
在常规情况下，妇女能够受孕的重要条件是：丈夫的精子达到一定数量，并且活动度良好。但在滴虫感染时，阴道的pH值一般为5～6，而正常阴道的pH值应为4。2～5。阴道内环境酸碱度的改变会使精子的活动力受到影响。
另外，滴虫能够吞噬精子，且患滴虫性阴道炎时，阴道内脓性分泌物大量增多，分泌物中含有大量的白细胞，这些都会妨碍精子的成活，使精子数量减少。
精子数量既少，活动度又不好，就很有可能引起不孕。滴虫病患者中不孕者约占19% ，但这并不是不可逆的，大多数人在滴虫病治愈后，生育能力可以得到恢复。